有各种各样的问题，但是对于朝廷来说，毕竟是主要的选官渠道，进士出身的官员，也是大明官员中的中坚和骨干。

同时张居正认为，明法、明算两科，即便是取中，授予的官职也肯定很低，但是现在朝廷正式用人之际，为了解决朝廷紧缺的司法、审计等官员的缺乏问题，朝廷应该从新科进士、举人中选取愿意学习律令、算学的人才，送国子监和律例馆学习相应的知识，期满之后予以考核，考核合格的授予相应的官职，以满足朝廷的急迫的用人需求。

朱载坖看了张居正的密疏之后，不由得感叹自己这位首辅心思缜密和敏锐，很显然，张居正已经明白了朱载坖要开这两科的用意，而且提出了相应的办法，张居正作为首辅，不仅仅是朱载坖的首辅，更是百官之首，要暌理阴阳，他很清楚朱载坖的用意，同时也提出了自己的解决办法，就是同时开设两科，但是要予以限制。

张居正的主意是很精妙，明法、明算两科的出身肯定是要在进士、举人之下的，而且有专业局限，而张居正通过将进士、举人进行专业培训之后调入相应的部门，提前布局，即便是日后开科，这些相应的衙门正印仍旧是进士、举人，通过这种方式锁死这两科出身的上限。